MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome linear

Total Repeats: 40984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015508	TGG	2	6	266909	266914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715621
5002	NC_015508	GT	3	6	266932	266937	0 %	50 %	50 %	0 %	332715621
5003	NC_015508	GAAAA	2	10	266956	266965	80 %	0 %	20 %	0 %	332715621
5004	NC_015508	CAG	2	6	266982	266987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715621
5005	NC_015508	AGG	2	6	267046	267051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715621
5006	NC_015508	AGC	2	6	267154	267159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715621
5007	NC_015508	GTTTC	2	10	267246	267255	0 %	60 %	20 %	20 %	332715621
5008	NC_015508	GTCG	2	8	267266	267273	0 %	25 %	50 %	25 %	332715621
5009	NC_015508	ATC	2	6	267391	267396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715621
5010	NC_015508	T	6	6	267415	267420	0 %	100 %	0 %	0 %	332715621
5011	NC_015508	TGA	2	6	267427	267432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715621
5012	NC_015508	CGG	2	6	267468	267473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715621
5013	NC_015508	TTA	2	6	267499	267504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332715621
5014	NC_015508	CGC	3	9	267527	267535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715621
5015	NC_015508	CGG	2	6	267683	267688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715621
5016	NC_015508	CGC	2	6	267708	267713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715621
5017	NC_015508	AAC	2	6	267714	267719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715621
5018	NC_015508	CGA	2	6	267722	267727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715621
5019	NC_015508	CGG	2	6	267737	267742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715621
5020	NC_015508	AGA	2	6	267961	267966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715621
5021	NC_015508	TCCA	2	8	267972	267979	25 %	25 %	0 %	50 %	332715621
5022	NC_015508	CAA	2	6	267983	267988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715621
5023	NC_015508	TGA	2	6	268038	268043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715621
5024	NC_015508	ATC	2	6	268294	268299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715622
5025	NC_015508	ATC	2	6	268301	268306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715622
5026	NC_015508	TAG	2	6	268316	268321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715622
5027	NC_015508	TG	4	8	268334	268341	0 %	50 %	50 %	0 %	332715622
5028	NC_015508	T	6	6	268348	268353	0 %	100 %	0 %	0 %	332715622
5029	NC_015508	GCC	2	6	268374	268379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715622
5030	NC_015508	AAG	2	6	268439	268444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715622
5031	NC_015508	TGG	2	6	268473	268478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715622
5032	NC_015508	GGC	2	6	268571	268576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715622
5033	NC_015508	CTC	2	6	268633	268638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715622
5034	NC_015508	GAC	2	6	268728	268733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715622
5035	NC_015508	CTG	2	6	268816	268821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715622
5036	NC_015508	TGC	2	6	268841	268846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715622
5037	NC_015508	CGA	2	6	268853	268858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715622
5038	NC_015508	AT	3	6	268891	268896	50 %	50 %	0 %	0 %	332715622
5039	NC_015508	TGCCG	2	10	268956	268965	0 %	20 %	40 %	40 %	332715622
5040	NC_015508	CGA	2	6	269019	269024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715622
5041	NC_015508	GTTGG	2	10	269173	269182	0 %	40 %	60 %	0 %	332715622
5042	NC_015508	T	6	6	269268	269273	0 %	100 %	0 %	0 %	332715622
5043	NC_015508	T	6	6	269278	269283	0 %	100 %	0 %	0 %	332715622
5044	NC_015508	CGG	3	9	269351	269359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715622
5045	NC_015508	TGA	2	6	269399	269404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715622
5046	NC_015508	ATC	3	9	269416	269424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715622
5047	NC_015508	ATTT	2	8	269437	269444	25 %	75 %	0 %	0 %	332715622
5048	NC_015508	CGG	2	6	269555	269560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715622
5049	NC_015508	ACG	2	6	269813	269818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715622
5050	NC_015508	TTG	2	6	269867	269872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715622
5051	NC_015508	GAC	2	6	270016	270021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715622
5052	NC_015508	GAG	2	6	270128	270133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715622
5053	NC_015508	GAA	2	6	270138	270143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715622
5054	NC_015508	CCA	2	6	270403	270408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715623
5055	NC_015508	GCA	2	6	270449	270454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715623
5056	NC_015508	GATAT	2	10	270470	270479	40 %	40 %	20 %	0 %	332715623
5057	NC_015508	TTGG	2	8	270563	270570	0 %	50 %	50 %	0 %	332715623
5058	NC_015508	TGG	2	6	270582	270587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715623
5059	NC_015508	ATT	2	6	270761	270766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332715624
5060	NC_015508	GCCC	2	8	270784	270791	0 %	0 %	25 %	75 %	332715624
5061	NC_015508	TGTT	2	8	270822	270829	0 %	75 %	25 %	0 %	332715624
5062	NC_015508	AAG	2	6	270848	270853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715624
5063	NC_015508	TGA	2	6	270865	270870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715624
5064	NC_015508	GAA	2	6	270885	270890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715624
5065	NC_015508	CG	4	8	270945	270952	0 %	0 %	50 %	50 %	332715624
5066	NC_015508	GTT	2	6	270971	270976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715624
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5069	NC_015508	CGG	2	6	271274	271279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715624
5070	NC_015508	TGA	2	6	271282	271287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715624
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5073	NC_015508	TGT	2	6	271486	271491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715624
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5077	NC_015508	G	6	6	271572	271577	0 %	0 %	100 %	0 %	332715624
5078	NC_015508	ATT	2	6	271669	271674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332715625
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5081	NC_015508	AGT	2	6	271825	271830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715625
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5083	NC_015508	CTTCG	2	10	271892	271901	0 %	40 %	20 %	40 %	332715625
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5086	NC_015508	TCG	2	6	271983	271988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715625
5087	NC_015508	AATG	2	8	272659	272666	50 %	25 %	25 %	0 %	332715626
5088	NC_015508	CGC	2	6	272691	272696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715626
5089	NC_015508	TTC	2	6	272697	272702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715626
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5094	NC_015508	GTG	2	6	272794	272799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715626
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5099	NC_015508	C	6	6	272964	272969	0 %	0 %	0 %	100 %	332715626
5100	NC_015508	ACG	2	6	272975	272980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715626
5101	NC_015508	TCT	2	6	272994	272999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715626
5102	NC_015508	CTC	2	6	273118	273123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715626
5103	NC_015508	GTC	2	6	273146	273151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715626
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5108	NC_015508	GGC	2	6	273451	273456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715626
5109	NC_015508	TTC	2	6	273458	273463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715626
5110	NC_015508	TGG	2	6	273476	273481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715626
5111	NC_015508	GA	3	6	273496	273501	50 %	0 %	50 %	0 %	332715626
5112	NC_015508	CCG	2	6	273674	273679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715626
5113	NC_015508	CCTT	2	8	273729	273736	0 %	50 %	0 %	50 %	332715626
5114	NC_015508	ACC	2	6	273743	273748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715626
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5118	NC_015508	GCCA	2	8	273967	273974	25 %	0 %	25 %	50 %	332715626
5119	NC_015508	GGC	2	6	274036	274041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715626
5120	NC_015508	CCGC	2	8	274124	274131	0 %	0 %	25 %	75 %	332715626
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5122	NC_015508	TTG	2	6	274271	274276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715626
5123	NC_015508	ACG	2	6	274281	274286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715626
5124	NC_015508	TA	3	6	274298	274303	50 %	50 %	0 %	0 %	332715626
5125	NC_015508	GGCT	2	8	274334	274341	0 %	25 %	50 %	25 %	332715626
5126	NC_015508	GAA	2	6	274406	274411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715626
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5128	NC_015508	ACG	2	6	274428	274433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715626
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5162	NC_015508	GCT	3	9	276198	276206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715627
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5242	NC_015508	GCA	2	6	281635	281640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715632
5243	NC_015508	GCTT	2	8	281661	281668	0 %	50 %	25 %	25 %	332715632
5244	NC_015508	CAA	2	6	281674	281679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715632
5245	NC_015508	GTCG	2	8	281688	281695	0 %	25 %	50 %	25 %	332715632
5246	NC_015508	GAT	2	6	281726	281731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715632
5247	NC_015508	CGA	2	6	281761	281766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715632
5248	NC_015508	CGGA	2	8	281784	281791	25 %	0 %	50 %	25 %	332715632
5249	NC_015508	TCCAT	2	10	281844	281853	20 %	40 %	0 %	40 %	332715632
5250	NC_015508	CAA	2	6	281885	281890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715632
5251	NC_015508	CTT	2	6	281960	281965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715632
5252	NC_015508	GGTT	2	8	282000	282007	0 %	50 %	50 %	0 %	332715632
5253	NC_015508	GCGATC	2	12	282134	282145	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	332715633
5254	NC_015508	CGT	2	6	282146	282151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715633
5255	NC_015508	CT	3	6	282196	282201	0 %	50 %	0 %	50 %	332715633
5256	NC_015508	TCG	2	6	282271	282276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715633
5257	NC_015508	GGA	2	6	282403	282408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715633
5258	NC_015508	ATG	2	6	282432	282437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715633
5259	NC_015508	GGT	2	6	282499	282504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715633
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5261	NC_015508	CTT	2	6	282694	282699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715634
5262	NC_015508	CCGA	2	8	282713	282720	25 %	0 %	25 %	50 %	332715634
5263	NC_015508	GGA	2	6	282814	282819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715634
5264	NC_015508	CAA	2	6	282865	282870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715634
5265	NC_015508	TGA	2	6	282885	282890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715634
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5268	NC_015508	GATCG	2	10	283387	283396	20 %	20 %	40 %	20 %	332715635
5269	NC_015508	GAC	2	6	283409	283414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715635
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5272	NC_015508	GCG	2	6	283475	283480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715635
5273	NC_015508	GTT	3	9	283493	283501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715635
5274	NC_015508	TC	3	6	283514	283519	0 %	50 %	0 %	50 %	332715635
5275	NC_015508	TTG	2	6	283677	283682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715635
5276	NC_015508	T	6	6	283733	283738	0 %	100 %	0 %	0 %	332715635
5277	NC_015508	CTC	2	6	283750	283755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715635
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5279	NC_015508	TCG	2	6	283848	283853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715635
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5282	NC_015508	CGT	2	6	284005	284010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715635
5283	NC_015508	GCG	2	6	284135	284140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715635
5284	NC_015508	GTC	2	6	284183	284188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715635
5285	NC_015508	GGT	2	6	284222	284227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715635
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5293	NC_015508	ATC	2	6	284738	284743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715635
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5325	NC_015508	CATC	2	8	286418	286425	25 %	25 %	0 %	50 %	332715637
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5332	NC_015508	TCT	3	9	286913	286921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715637
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5334	NC_015508	GCCC	2	8	287178	287185	0 %	0 %	25 %	75 %	332715638
5335	NC_015508	AT	3	6	287216	287221	50 %	50 %	0 %	0 %	332715638
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5351	NC_015508	GGCG	2	8	287920	287927	0 %	0 %	75 %	25 %	332715639
5352	NC_015508	TTA	2	6	288034	288039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332715639
5353	NC_015508	GCAC	2	8	288107	288114	25 %	0 %	25 %	50 %	332715639
5354	NC_015508	CGG	2	6	288133	288138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715639
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5356	NC_015508	GC	3	6	288192	288197	0 %	0 %	50 %	50 %	332715639
5357	NC_015508	GGAA	2	8	288286	288293	50 %	0 %	50 %	0 %	332715639
5358	NC_015508	CGC	2	6	288301	288306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715639
5359	NC_015508	TC	3	6	288323	288328	0 %	50 %	0 %	50 %	332715639
5360	NC_015508	GCCA	2	8	288337	288344	25 %	0 %	25 %	50 %	332715639
5361	NC_015508	A	8	8	288350	288357	100 %	0 %	0 %	0 %	332715639
5362	NC_015508	CTC	2	6	288367	288372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715639
5363	NC_015508	ATC	2	6	288410	288415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715639
5364	NC_015508	CAT	2	6	288418	288423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715639
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5366	NC_015508	CGG	2	6	288448	288453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715639
5367	NC_015508	GGT	3	9	288466	288474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715639
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5483	NC_015508	ATG	2	6	295509	295514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715646
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5485	NC_015508	CG	3	6	295565	295570	0 %	0 %	50 %	50 %	332715646
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